因为胃镜检查是一种侵入性检查，需要经过口腔、咽部、食道，进入胃、十二指肠。很多人觉得胃镜是否会对食管、胃有刺激或者损伤。一般普通胃镜会有不适感，主要是恶心，少数人检查完之后，可能会觉得咽部不适。但是先进的胃镜已经做的很柔软光滑，它的外面是一层柔软的胶皮，对人体一般没有任何损害。除取活检时，可能对胃造成损伤，或者切息肉时对胃造成损伤，如胃部出现创面，但创面较小，类似在日常活动中不小心碰到墙或者摔倒时，皮肤黏膜挫伤或者掉皮。如果没有进行任何检查和治疗，基本上对胃没有损伤，因此常规胃镜检查对人的损伤较小。
