牙结石是因为没有及时将牙齿刷干净，停留在牙齿表面的细菌利用口腔里的食物残渣、唾液，包括钙、磷等，在牙齿表面形成的矿化沉积。因此牙齿表面不干净在专业上又称为细菌斑块，牙菌斑，牙结石则称为矿化的牙菌斑。
牙结石主要为细菌的代谢产物，牙齿上不干净，多数都为细菌导致。因此，牙结石很大程度上会导致口臭。但口臭还有其它原因，需具体分析。