发生尿道炎的时候，肌肉注射药物，通常选择抗生素。因为在尿道炎的发生当中，有非特异性的，也有特异性的，以特异性的尿道炎更多见，比如淋菌性尿道炎。
此时推荐应用肌肉注射的药物是头孢曲松钠，还可以选择左氧氟沙星或者头孢克肟等药物进行治疗。如果不能除外如支原体、衣原体这类病原微生物感染，建议患者加用阿奇霉素或者多西环素进行处理。
在特异性尿道炎当中，还有一种是非淋菌性尿道炎，主要的病原微生物是支原体和衣原体，在治疗上一般不需要肌肉注射药物。主要是口服药物，主要应用是多西环素或者阿奇霉素，也可以应用左氧氟沙星进行治疗。
通常除了药物治疗以外，要求患者多饮水、注意休息，多生成尿液形成冲刷作用，暂停性生活。如果有性伴侣，性伴侣也要同时进行治疗，在生活上，要注意处理好自己的随身衣物，如内裤、被褥等。
