神经中枢主要位于脑与脊髓，也称中枢神经系统，包括大脑即端脑、间脑、脑干与小脑，大脑包括大脑皮层与皮层下白质纤维，中间基底节功能区域，大脑下面为间脑包括丘脑、下丘脑、底丘脑以及上丘脑。间脑向下连接脑干，脑干由上到下依次为中脑、脑桥、延髓，后部为小脑主要位于整个颅腔内。

颅腔下面为脊髓，主要存在于脊柱中央，如颈椎内侧有颈髓、胸椎内侧椎管内有胸髓等。通常脊髓截止于第二腰椎，向下属于神经结构，但脊髓包括颈髓、胸髓、腰髓、骶髓四部分。