大部分的龟头炎可以抹红霉素软膏，因为龟头炎大部分是急性、浅表性的龟头炎，致病菌通常是大肠杆菌和表皮葡萄球菌，这时候使用红霉素类抗生素软膏，治疗7-10天之后，就会有显著地改善。
如果患者同时有包皮过长、包茎的情况，建议在龟头炎治好后，尽早做包皮环切手术。如果使用红霉素软膏，治疗7天以后症状没有消失，甚至出现局部皮损，比如溃疡、红肿加重，这时候要高度怀疑是其他病原体导致的龟头炎，常见的比如霉菌，还有滴虫。
这时候可以做龟头分泌物涂片，包括病原微生物鉴定。如果证实是霉菌感染所致，要把外用的软膏调整为抗真菌的克霉唑软膏；如果证实是滴虫感染，推荐可以使用甲硝唑口服进行治疗。所有的龟头炎患者应尽量规避性生活，实在要过性生活，一定要全程使用阴茎套，防止该病的交叉传播。
