结核肾的超声表现主要为患肾结构紊乱，如果有钙化灶，钙化灶通常呈现出高位肾，B超同时可以诊断对侧肾积水和膀胱挛缩。在结核的影像学诊断当中，B超通常作为筛查手段，对早期诊断没有太多帮助，需要结合尿中抗酸杆菌、静脉肾盂造影或者逆行造影、CT、磁共振等综合影像学检查进行诊断。除B超外，最常应用于结核诊断的是尿路造影，尿路造影可以在早期显示出肾小盏破坏，随着疾病进展，这种破坏可能进一步加重，肾脏结构会出现紊乱。
如果尿液中存在抗酸杆菌，加上一侧不显影，即可诊断为肾结核。CT特征性表现是患者肾脏肾盂、肾盏扩张，可以有空洞出现，也可以有钙化灶。三维成像可以显示出尿管全长，磁共振水成像对对侧肾积水有独到的诊断之处，通常为辅助诊断手段。
