高密度脂蛋白是抗动脉粥样硬化的卫士，它的合成主要是在肝脏和小肠。高密度脂蛋白出现水平偏低时，提示可能存在高脂血症，或存在严重的肝脏和胃肠道的疾患。

严重肝脏疾患的患者，通常蛋白水平也较低，会出现血脂的异常。其中最常见的会出现保护性的血脂蛋白，即高密度脂蛋白的偏低，以及不好的血脂蛋白，如低密度脂蛋白、极低密度脂蛋白、甘油三酯、胆固醇水平的偏高。肠道的疾患，造成合成功能下降，也会引起高密度脂蛋白的下降。

高密度脂蛋白的作用，是逆向转运胆固醇、甘油三酯的作用，可以将外周组织的胆固醇、甘油三酯逆向转运回肝脏，进行再次利用，或以胆汁酸的形式，再次排泄到体外，从而达到降低血脂的目的。若高密度脂蛋白这层保护因子下降，势必会引起血脂水平的异常，如血脂水平的升高，增加心脑血管的风险因素。因此对于高密度脂蛋白需引起重视，及时控制好血糖、血压、血脂以及体重。