脚后跟两侧疼痛的原因大致如下：

1、软组织损伤：如肌肉拉伤，筋膜、肌腱损伤，由于患者受外伤或者活动量过大，经常跑步、跳舞、跳绳等剧烈活动后，就会引起肌腱以及跟腱周围脚后跟的肌肉和骨质挫伤，引起局部创伤严重反应，大量炎症物质聚集后，诱发脚后跟两侧疼痛；

2、长期慢性劳损：经常站立、走路、爬山、爬楼梯，都可以造成局部的慢性炎症反应，大量炎症介质在局部聚集，或者代谢后产生大量的乳酸堆积，都可以造成局部肌肉僵硬、疲劳感，出现局部积液导致疼痛；

3、骨质异常：如老年患者的骨质疏松，或者局部长骨刺，骨质增生诱发跟痛症，骨刺或者异常骨质刺激周围肌肉，本身骨质疏松承受重量的能力也明显减弱，会造成微小骨折，从而诱发疼痛；

4、感染：如细菌感染引起化脓性炎症，或者结核在骨和软组织内发生，聚集在脚后跟部位，也会出现局部红、肿、热、痛的情况；

5、营养代谢疾病：如风湿、类风湿、尿酸增高以及痛风，在寒冷刺激受凉、劳累、免疫力下降、饮食不当的情况，都可以造成疾病发作，而诱发局部疼痛。痛风可能会出现剧烈疼痛，局部皮肤温度增高，出现红、肿的现象。

因此，脚后跟两侧疼痛的原因比较复杂，需要根据患者的病情，或者临床表现辅助检查，明确诊断。