宫颈癌疫苗上市已经有十余年，目前的安全研究数据认为宫颈癌疫苗不影响怀孕。注射宫颈癌疫苗通常需要6个月，在此期间，通常建议患者不要怀孕，等待接种结束后，再去考虑怀孕问题，对今后的生育就没有影响。如果患者在接种宫颈癌疫苗期间出现怀孕的情况，也不需要做流产，但是建议患者暂时不要接种后续未接种的针剂，等到完成分娩后再去接种。
WHO在2017年发布了关于HPV疫苗的立场文件，文件内的数据表明，宫颈癌疫苗的主要副作用为注射部位发生疼痛、硬结或者注射后产生低热，但发生概率不高，并且主要以局部为主。网络流传的注射宫颈癌疫苗后的副作用会导致发生免疫系统疾病，以及对怀孕产生影响，并没有完整的数据支持，宫颈癌疫苗相对比较安全，对怀孕没有特殊的影响。
