细菌感染性疾病通常都有自然病程，病毒感染周期决定自愈能力或时间。毛囊炎由金黄色葡萄球菌感染引起，通常在出现脓疱后，由于脓疱脓液流出，或用无菌针头挑开，使用消炎药，均可好转。

但毛囊炎外因没有去除时，如有些患者头发油腻，清洗不到位，容易在头部发生细菌感染，甚至合并真菌感染，产生糠秕孢子菌毛囊炎。这种情况要采用药物治疗，同时要清理毛巾、内衣，胸部需要清理贴身衣物，才能达到治愈。否则此部位毛囊炎治愈后，其它部位又会复发，即可反复发作。