流产后遗症有近期和远期，近期常见的有比如手术当天由于手术操作不当或本身子宫体偏软，会出现子宫穿孔甚至伤及肠管，需要做肠管修补术。部分女性在流产手术之后，出血时间较长，子宫复旧速度较慢。由于出血时间长，血液为良好的培养基，非常适合细菌和病毒的繁殖，可能会造成妇科炎症。妇科炎症上行，则可能会出现阴道炎、宫颈炎、子宫内膜炎、子宫体炎症以及盆腔炎症等，盆腔炎症可能会表现为急性盆腔炎或慢性盆腔炎。
还有部分女性流产手术之后，会出现月经推迟或月经紊乱。少部分女性可能手术后子宫内膜复旧差，会出现后期月经量特别少甚至闭经的情况。做B超或宫腔镜检查时，还可能会发现宫腔粘连，需要做粘连分解术，这些均为流产常见的后遗症。
