甲状腺微创消融术后后遗症主要包括两个方面，即短期后遗症和长期后遗症，具体如下：

1、短期后遗症：即手术后即刻的反应，主要包括颈部肿胀，是术中为保护甲状腺打隔离带、生理盐水所致，一般1-2天即可恢复。若肿块靠近神经，可能出现一过性热损伤，术后几天内大部分也可恢复，极个别患者3个月之内可以完全恢复。术前均需进行喉镜评估，声带功能正常的患者才可进行消融治疗，一侧损伤后另一侧可以代偿；

2、长期并发症：良性结节比较大，可能做不到彻底消融，因此后期个别患者可能局部复发。如果患者没有症状，其实可以不处理，如果后期长大比较明显，可以做二次补充消融。

对于甲状腺微小癌患者，仅对结节本身进行消融，没有处理淋巴结，因此后期存在小概率的淋巴结复发风险。一旦出现复发，需及时进行手术干预。对于甲状腺恶性结节患者而言，术后随访非常重要，早期发现淋巴结转移，早期进行干预，对患者的长期生存有明显差异。