婴儿进行核磁共振、CT等检查时，常因不能配合而需注射镇静剂，一般正常剂量使用多无明显副作用，个别患儿出现相关副作用如下所示：
1、过敏：部分婴儿可能对镇静剂过敏，前1-2次使用时可能出现皮疹或局部红肿现象；
2、巨幼红细胞性贫血：部分婴儿可能出现巨幼红细胞性贫血，即叶酸缺乏导致，但属于罕见现象；
3、肾功能改变：所有药物需经过肝脏代谢、肾脏排泄，如果婴儿肝肾功能不佳，则需注意监测肾功能。
此外，如果长期使用镇静剂，如部分特殊婴儿可能存在肿瘤，需进行化疗等治疗，经常需复查相关检查，此时使用镇静剂次数较多或较频繁，可出现耐药现象，表现为最初使用时婴儿睡眠较好，此后使用因为耐药可能无法入睡。家长应在检查前让婴儿处于缺觉、疲劳状态，此时使用镇静剂可发挥较好效果，以顺利完成检查。
