通常不能单纯依靠B超检查诊断卵巢早衰，应观察卵巢大小、是否存在卵泡和小卵泡。医师在进行B超检查时，如果无法发现卵泡，同时患者年龄在40岁以上，则可能为卵巢早衰。进行诊断时还需要进行内分泌检测，即FSH、LH、窦卵泡数目及AMH抗缪勒管激素等。

部分女性存在特殊原因不排卵，如重大精神打击、严重营养不良及严重疾病，会造成短期内卵巢不排卵、激素水平较低。通常去除病因后即可恢复，不属于卵巢早衰。