脑干损伤实际上是颅脑损伤中的特殊类型，所以一旦发生了脑干损伤，大多数患者的病情都比较重，而且没有特效的治疗方法。脑干是颅脑最中心的部位，也就是中脑、桥脑、延髓的总称，实际上是人脑的中枢，也就是控制意识、心跳、血压、呼吸中枢，是人脑最重要的结构。患者往往表现为持续性的昏迷，多合并血压、心跳、呼吸的改变。这种情况下，医生能做的也只是保持患者各项指标的平稳，可以用神经修复的药物或辅助高压氧等康复手段。
总而言之，受损的脑干组织需要非常长的时间才可能得到比较好的修复，但脑干损伤的修复时间至少要一个月以上，甚至更长。很多重症脑干损伤的患者可以长期昏迷，甚至永远不能苏醒，成为植物生存状态，这也是最危险的情况。大多数轻中型脑干损伤的患者，能够得到比较好的恢复。
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