腺病毒感染没有特效药，所以治疗方法为综合治疗，帮助病人渡过难关。因腺病毒肺炎是肺部炎症，治疗原则为消除炎症，改善通气。所以这类病人需给氧支持，保持呼吸道通畅。而肺炎治疗原则为对症治疗，出现高烧的患者需降温；如果气道炎症严重，符合严重的中毒症状，可使用糖皮质激素、丙种球蛋白。

腺病毒肺炎没有特效药，有时医生会用病毒唑类药物，但效果不确切。腺病毒感染后可导致免疫功能的损害，通常合并细菌感染。所以当有细菌感染的苗头时，需要给予患者抗生素治疗。