只要是有骨骼存在的地方，都可能会发生骨肿瘤。但是骨肿瘤最常见的发病部位，应该是在长骨的骨端或者是儿童的干骺端。因为此处血管相对比较迂曲、血供又比较丰富，是骨肿瘤最为好发的部位，如骨巨细胞瘤喜欢发生在骨端，而另外部分肿瘤就好发于干骺端，如儿童比较恶性的肿瘤，骨的骨肉瘤；还有发生在骺板的附近如骨母细胞瘤；当然还有部分肿瘤喜欢发生在长骨的内侧、内部，如长骨的内生软骨瘤或者是短骨的内生软骨瘤，也是骨肿瘤比较好发的部位。
但是人群应该认识到骨，无论是颅骨等不规则的骨，还是长管状骨、肋骨等部位均具有骨的特性，都可以发生骨肿瘤。只是骨肿瘤具有一定的好发的倾向，在某些部位比较容易好发，如骨端和干骺端。
