支气管结核诊断依赖于流行病学、病史及临床表现、结核分枝杆菌、胸部影像学检查、PPD试验及支气管镜等相关检查，全面进行分析后做出诊断，气管、支气管结核患者临床表现缺乏特异性，影像学检查具有局限性。

目前支气管结核确诊，仍然依赖于支气管镜检查及细菌学或病理学证据，部分患者需纤维支气管镜直视下行病变观察、病变活检、刷检，经支气管肺活检、支气管灌注液检查等，对所获取标本进行病理组织学、结核菌涂片、分子生物学检测及结核菌培养等。可以通过吸取痰液、分泌物及支气管灌洗液细菌学、免疫学、生化学、酶学、微量元素、定量PCR等检查，提高气管、支气管结核诊断水平。