高血压脑出血最好发部位为基底节区，其是脑室深部的神经核团，包括豆状核、尾状核、杏仁核和屏状核，其中豆状核包括苍白球和壳核。脑出血易发生在壳核中，大脑中动脉分支临床叫豆纹动脉，从大脑中动脉主干呈直角发出。角度较大的情况下，直接发出速度和水流一样，受到冲击力较大，容易引起破裂出血，导致壳核出血发生率最高，引起相应临床表现。

其它部位，包括脑皮质下、脑干、小脑也是出血的好发区域，但是基底节区最常见，占脑出血70%左右。在临床表现出的偏瘫、偏身感觉障碍、偏盲等，都是基底节区出血表现。