扁平疣属于病毒感染，特点是有同形反应，同形反应即顺着抠和抓的印迹会起新疹子，所以扁平疣的治疗比较困难，容易复发。目前可以选择迪维霜外用，有剥脱、去角化的作用，该药可去掉增生性皮肤病损，所以可以外用。

如果外用药效果不好，还可以冷冻去掉或激光打掉。但扁平疣有同形反应，有时候会再长。以前有传统方法是注射维生素B12，但有的病人会形成非特异性刺激反应；也可以注射聚肌胞，现在可能用的比较少。当然，患者还可以用活血化瘀、软坚散结的中药，在中医师的指导下吃中药的效果较好。