对于脑寄生虫病，首先要明确是哪种虫体导致的，选用相应的敏感药物将其消灭。药物将寄生虫消灭后，在颅内遗留的病灶会逐渐进行机化或吸收，从而达到治愈的目的。但有些寄生虫在颅内形成局部的包膜包裹，药物治疗效果不佳，此时需进行神经外科手术切除，病灶切除后也可达到治愈的目的。

寄生虫病在颅内形成局部病灶时，用药物治疗有时效果并不理想，需要进行多个疗程的治疗，之后还需评判局部病灶是否对相应的神经系统造成损害，或者对脑神经有挤压、压迫症状，必要时还需神经外科手术辅助治疗。