碘在人体内主要参与甲状腺激素合成，基本通过甲状腺激素的作用来反映其生理功能。碘可以促进生长发育，促进神经系统以及肌肉发育，还可促进脂类、糖类、蛋白质代谢，是参与多数酶的重要组成成分。

缺碘时会导致甲状腺肿大，碘缺乏会刺激垂体大量分泌促甲状腺激素TSH，TSH可以作用于甲状腺组织，使甲状腺组织代偿性增大。碘缺乏区域易出现聚集性甲状腺肿大，出现大脖子病，所以碘必不可少。孕妇出现碘缺乏，会影响到胎儿神经系统和肌肉发育，出现智力下降等情况。目前食用盐几乎均含碘，常为加碘盐，饮食中的碘过量易导致高碘性甲状腺肿、甲状腺亢进，所以人体对碘的摄入需要适量。