同房后出现尿道疼痛，大多由感染引起，比如尿道炎。因为同房时会阴或尿道器官均处于相对充血的状态，细菌容易从尿道外口逆行进入尿道内，在尿道和膀胱中定植，形成感染的情况。
出现膀胱炎、尿道炎感染的时候，会出现尿道疼痛，尿道本身可能也会出现疼痛或刺痒的感觉。在排尿时疼痛会加重，出现尿道内严重刺痛或烧灼样痛。同房后出现尿道内疼痛不适，部分患者可能会伴有尿频、尿急的症状，此时需高度怀疑出现泌尿系统感染，需及时到医院进行尿常规检测。如果尿液中白细胞增高，确认有泌尿系统感染存在的情况下，需根据具体感染类型、病情程度，选用相应的抗生素进行抗感染治疗。
