胃镜主要是从口腔到咽喉部，然后到食管，最后进入胃，所以对于食管和胃，胃镜检查还是能够做到的，而且是相对比较充分的。胃镜过了口咽以后，在进镜和推镜的过程中，通过对食道和胃的黏膜进行详细的观察。食管和胃的糜烂、溃疡、血管曲张，或者新生物，甚至肿瘤，通过胃镜的检查，多数是可以发现的。

有些普通胃镜发现不了，现在又有新的技术手段，通过超声胃镜可以透过食管和胃壁，透过黏膜面看到肌层、浆膜面甚至更深层的组织。所以现在胃镜和超声胃镜对于食管和胃疾病的诊断有很大的帮助。