第二次根管治疗以后牙痛属于不正常现象，第二次根管治疗以后牙痛常见以下几种原因：

1、第二次根管治疗一般是做根管扩大，放入消炎药，此时根管疼痛可能与残留牙神经或者与根管解剖变异有关；

2、做第二次治疗时，比如做根管扩大时可能刺激根尖组织，导致根尖组织有炎性渗出，尤其是封药以后，炎性渗出无法排出，引起牙腔压力比较大，导致患者出现疼痛症状。

如果有残留牙神经，需要借助牙CT，甚至显微根管治疗，通过根管显微镜找到残留牙根管，把牙神经拔掉，然后再进行消炎治疗，后续进行充填治疗。如果根尖组织有渗出，可能需要把封药暂时去掉，使牙髓腔开放几天，等炎性渗出减少，压力减小以后再封药消炎，后续再做充填治疗。从该意义而言，根管治疗以后出现疼痛属于不正常现象。