漏斗胸手术是非常专业的手术，手术本身具有危险性。漏斗胸因凹陷的胸壁会压迫到心脏，若想解除压迫，就需在压迫心脏的前胸壁和心脏之间无缝隙的部位放入支撑物。但在放置支撑物过程中，危险性较大，据国外资料记载，部分病例可能在放置支撑物时损伤心脏。

但国内目前还未出现此类报道，可能是由于全世界范围内，国内的胸外科医生进行漏斗胸手术的病例数，远超其它国家和地区，因此经验丰富。目前国内进行的手术，还未有数据报道出现较大的并发症。