大部分咽喉部白色颗粒是因为咽喉部异常角化症，即咽角化症所致，主要发生于咽扁桃体和舌扁桃体，其它部位较少见。角化症多发生于30岁以前的年轻人，主要是由于局部口腔卫生不好、鼻淋巴滤泡炎症等引起。另外纤毛菌等细菌感染，可造成分泌物难以正常分泌，形成白色角化物，且贴附在表面不易剥离，比较坚硬，如石头。

也可能是扁桃体方面的问题，如扁桃体结石，是因为在腺窝分泌的黏液分泌不畅聚集，加上本身带有钙化物结晶，即可形成结石。另外，扁桃体本身有炎症，导致阻塞，无法正常代谢，也可形成结石。表现为扁桃体表面出现白色颗粒物，还会引起口臭，且部分病人的口臭比较明显。