舌头分叉有可能是先天性的因素所造成，还有可能是免疫系统紊乱，或者是内分泌紊乱所引起的后天改变，可能还与舌头损伤有一定的关系。
因此，造成舌头分叉的病因很多，若要找寻导致此现象的具体原因，需观察患者口内的情况以及舌头分叉形态、程度、位置等。另外，还要观察患者舌系带、咬合关系、口腔的情况等综合而定。
导致舌头分叉的原因，若是先天性因素，并且是舌系带过短所引起，可通过舌系带延长术以及相关的一些手术，进行相应矫正。
若是由于全身系统性疾病，在口腔的表现，例如内分泌系统紊乱或免疫系统低下的患者。此类原因所引起的舌头分叉，需明确导致患者舌头分叉的病因，将患者的全身因素治愈，才可能解决问题。
