受精卵在子宫腔以外的部位着床发育称为异位妊娠，即宫外孕，以输卵管妊娠最为常见。宫外孕的诊断主要是通过B超联合血HCG检查，孕酮只是辅助检查，不能单纯通过孕酮值的高低判断是否存在宫外孕。孕酮低于15ng/ml的时候考虑胚胎发育不佳，有宫外孕的可能，但是也有可能是宫内胚胎发育不良，存在流产的情况。
多数宫外孕由于着床部位的血运不佳导致胚胎发育不良，所以会出现孕酮的低水平状态。但是也有小部分的宫外孕，比如输卵管间质部的妊娠，因为宫角部肌层比较厚，胚胎着床部位的血运较好，所以不一定会出现孕酮的低水平。所以孕酮高只能说明胚胎发育良好而不能证明胚胎着床的位置。正常情况下，存在宫内孕女性的血HCG每48小时成倍增长，而宫外孕女性的血HCG每48小时增长＜66%。如果HCG＞1500IU/L，阴道B超看不到宫内胎囊，而附件区有包块，则考虑宫外孕的可能性比较大。因此在妊娠早期建议查血HCG、孕酮、阴道B超，以尽早判断是否为宫内孕以及胚胎的发育情况。
