脑干轻微损伤有机会恢复，如果是点片状出血，患者出现症状相对比较轻微，这类患者预后非常良好，日后可能不会留下后遗症。

但是脑干损伤不同，会引起患者出现长时间昏迷，而昏迷一般会造成植物状态，即植物人。一旦出现这种状况，患者可能会面临气管切开或者气管插管、机械通气，患者卧床后会出现相应肺部炎症、褥疮、下肢静脉血栓、尿路感染等并发症。出现并发症会大大延长患者恢复时间，也会给患者增加更多复杂病症。

因此，原发性脑干损伤恢复要取决于脑干损伤程度，但是脑干损伤一旦形成，遗留下后遗症的可能性极大。