目前研究没有证据表明，大蒜素单纯能够杀死幽门螺杆菌，目前要根治幽门螺杆菌，主要还是通过三联或四联的规范治疗。在选择抗生素时应选择敏感的抗生素，若患者所处地区对某种抗生素普遍耐药，应放弃此种抗生素。治疗疗程为10-14天，治疗后需及时复查，由于人群普遍易感，根除治疗后患者仍可能再次感染，所以需加强保护。

杀灭幽门螺杆菌后不应随意吃喝，增加交叉感染的机会，幽门螺杆菌治愈后不会形成强有力、永久的抵抗力。若患者坚决不肯服用四联抗生素，包括抑酸药治疗时也可尝试服用大蒜素，但疗效并不明确。