畸胎瘤是先天性疾病，是在怀孕过程中不太好的生殖细胞留在胎儿卵巢里，或某些其他部位，男孩子可以留在正中线，如脑，有时是气管后面，有时在纵隔等地方。女孩大部分留在双侧的卵巢，所以畸胎瘤是怀孕期间生殖错误造成。不算遗传性疾病，是妈妈的异常留下的。
至于为什么会出现，目前也不太清楚，但确实发现有的家族妇女可能有几个人都会有这样的问题，是不是有遗传问题目前没有明确的证据，所以只认为是先天性疾病，而不叫遗传性疾病。
畸胎瘤的错误是生殖细胞的错误，所以在发育过程中有可能一次就发育出来，一般在十几岁时比较多见。也可以有几次才能发育成为肿瘤，也就是有些人为什么会长了一次肿瘤，做完手术过两三年又长，是因为还有其它的异常细胞。
