通常血清阴性是指在化验中用于定性判断是否存在感染或某种疾病的判断方式，常用于检查是否有病毒、细菌感染，基础疾病，如强直性脊柱炎，通常化验是HLA-B27。病毒化验包括乙肝、梅毒、艾滋、丙肝等血化验，如果提示血清阴性，表示没有感染乙肝、丙肝、梅毒、艾滋等，如果结核抗体阴性，提示至少没有接触过结核患者。

自身免疫病，如强直性脊柱炎或类风湿性关节炎导致脊柱疼痛，称血清阴性脊柱关节病，通常是指强直性脊柱炎的HLA-B27的化验为阴性的脊柱病变。血清阴性是一种定性方法，表示某种疾病是否存在。