确诊肺结核，最特异的方法，是在患者痰液或者支气管分泌物里，找到结核杆菌，基本上可以确诊肺结核，亦标志患者具有传染性。但多数结核患者，化验痰或者支气管分泌物，不一定能够发现结核杆菌。

确诊肺结核，多数是通过影像学，如肺部CT检查，同时结合患者的临床症状，如乏力、盗汗、低热、咳嗽、咳痰、胸痛、咯血等全身或者呼吸道局部的表现。再加上免疫学表现，如结核菌素试验，以及干扰素释放试验等，综合判定患者有无结核。