青少年良性癫痫以药物治疗为主，根据患者发作类型、发作特点、脑电图特点选用抗癫痫药物，如奥卡西平、左乙拉西坦、德巴金等，多数患者通过药物治疗也获得较好疗效。有些类型的良性癫痫睡眠中出现加剧，称为睡眠中的癫痫性持续状态，此时需进一步调整用药，尽量避免使用加重脑内部损伤的药物。良性癫痫要先判断是否需要治疗，明确需要治疗后首选药物治疗。

青少年良性癫痫如果发作频率较低，如一年一次或者一年两次，则不需要治疗。如果发作频率较高，如半年内发生三次或者一年发生四次，则发作频率较高，需要治疗。良性癫痫大部分为夜间睡眠中发作，如果出现白天发作也需要治疗。发作持续状态，如半小时及以上较长时间的发作也需要治疗。