肝内胆管结石的时间对于治疗方案不起决定作用，主要根据具体病情选择治疗方案。若结石较小，未造成胆道梗阻，肝功能正常，这时通常无需治疗，平时适当注意生活方式，做到均衡膳食，少吃高胆固醇的食物，定期复查即可。若结石比较局限，引起胆道梗阻，这时可以考虑进行肝部分切除，彻底治疗结石。
若结石分布较广，同时引起肝功异常，可以考虑通过经肝门部胆管，置入胆道镜取石，一次取不干净可以放置体管，以后可以通过体管窦道反复取石。若结石已造成严重的肝硬化、肝功能失代偿，少数患者可能需要通过肝移植进行治疗。
因此肝内胆管结石的治疗，需要结合患者的病情，制定个体化的治疗方案，可以选择包括取石、肝切除，甚至是肝移植的方式进行处理。
