上颌骨囊肿手术分很多种，不同手术常见方法如下：

1、根尖囊肿：一般根尖囊肿不会特别大，可以直接进行根管治疗，刮掉囊肿即可；

2、角化囊肿：角化囊肿如果不是特别大，同样可以刮掉，如果比较大，直接刮刮不干净，比如位置靠后，可以做开窗手术，一方面可以让囊腔逐步缩小，便于刮得干净，另一方面有时囊腔里会有智齿，智齿位置比较高不好拔，通过开窗可以让智齿往下走，到合适位置时再刮囊肿，同时把智齿拔掉。如果囊肿特别大，且有些为多发，开窗手术效果不一定好，可能要局部截骨或刮除的范围比较大，手术难度比普通囊肿刮治难很多，且创伤较大；

3、颌骨囊性病变：比如成釉细胞瘤，虽然不是囊肿，但表现与囊肿差不多，治疗要求更高，比如治疗范围要更彻底，多数可能会选择截骨。