幽门螺杆菌2000比较严重，因为碳14尿素呼气试验正常值是0-100，2000已经是增高20倍，属于重度感染。如果是碳13尿素呼气试验，正常值是0-4，也是比较严重的情况，建议采取四联疗法14天进行根除。药物选择可以根据病人地域，以及平常用药进行挑选。如果经常吃青霉素类药物，则建议避免再选用青霉素类药物根除，因为机体可能存在耐药性。

另外可以进行药物敏感试验，选择最有效、最敏感的抗生素进行根除。通常应用14天，注意药物要足量，时间要足够，而且是联合用药。停药1个月以后一定及时进行复查以观察疗效，以免存在耐药性，如果间隔时间太长可能存在再感染的问题。