支原体感染依据支原体的类型不同，可以发生在肺部、泌尿系统、生殖系统。无论是肺部支原体感染、泌尿系统、女性阴道炎生殖系统的支原体感染，治疗的药物主要有两大类：
1、环内酯类抗生素：大环内酯类的抗生素临床比较常用的是红霉素、螺旋霉素、阿奇霉素；
2、氟喹诺酮类抗生素：喹诺酮类的药物可以有环丙沙星、加替沙星、左氧沙星、莫西沙星等。
当确诊支原体感染时，可以经验性选择大环内酯类的药物口服或喹诺酮类的药物口服2周-4周。病情迁延比较顽固的患者必要时需要通过支原体的培养、药物敏感试验，根据药物敏感实验选择相应敏感的抗生素进行临床治疗。
大多数情况下支原体感染，口服大环内酯类的药物和喹诺酮类的药物，都可以达到临床治愈。只是有些患者可能病程比较长，需要的时间可能相对长一些。
