感染性腹泻有多种病原体，夏秋季节所导致的常常是轮状病毒、诺如病毒，也有一些是食用腐败变质的食物，甚至霉菌所导致。还有一些是细菌导致，细菌感染是整个感染性腹泻里最常见的。

针对细菌导致的腹泻需要积极抗菌治疗，特别是针对肠道细菌。细菌导致腹泻多见于革兰氏阴性菌，特别是大肠杆菌所导致的腹泻，一般要使用针对革兰氏阴性菌的药物，比如喹诺酮类药物、头孢三代等，这些最常见的是用喹诺酮类的药物，治疗疗程一般急性感染，3天左右基本比较稳定。如果是慢性感染，疗程可以适当延长，或重度感染疗程也可以适当延长。