16岁男孩阴茎的尺寸接近正常人尺寸，通常正常的尺寸为10-14cm，周径为5-10cm。正常男孩7岁前，阴茎的长度通常为6cm以下，7-14岁阴茎的长度为6cm以上，14-18岁阴茎的长度为8-14cm。如果16岁，多数男孩阴茎长度为8-10cm，长可以达到14cm，短应该为8cm以上。

如果阴茎较短，则说明可能肥胖，阴茎在下腹部的皮下脂肪中，建议减肥。如果16岁男孩阴茎比较小，即幼稚型阴茎，可能是体内缺乏雄激素，应检查雄激素是否偏低。如果偏低，可以使用激素进行治疗。