拔完牙后，扁桃体疼，通常建议患者去医院耳鼻喉科就诊，通常有以下几种原因：

1、牙龈周围疼痛：由于拔牙后，牙龈周围疼痛，扩散到扁桃体区，实际上扁桃体并没有任何病变，但由于定位不准确，尤其在拔智齿后，与扁桃体结构挨得较近，可能让患者误以为是扁桃体疼痛；

2、扁桃体急性炎症：由于拔牙后，病菌，特别是细菌，可能通过组织间隙或者血行播散到达扁桃体，引起扁桃体疼痛。除牙齿周围的病变外，扁桃体还存在充血、发红，甚至表面有脓点或者脓苔，患者需要进行药物处理。