变应性肉芽肿性血管炎治疗的药物，主要依赖于糖皮质激素类药物和免疫抑制剂。较轻患者可以选用糖皮质激素类药物，效果较好，应用后症状如肺部阴影消失较快。

变应性肉芽肿性血管炎患者表现较重，如影响到外周神经，此时治疗力度需要加大，治疗药物种类可能需要增加。外周神经受累治疗疗程较长，恢复程度和轻症患者或肺部恢复相比可能更难。