查肝功能不是查肝癌的有效检测手段，通常有效的检测方法是影像学检查，包括肝脏彩超、CT或核磁，都能发现肝脏占位性病变。还有肝癌的一些特异性标志物，尤其甲胎蛋白，是经典的肝癌标志物，对于发现早期的肝癌，或者肝癌，都是非常直接的有效的措施。
肝功能检查中，有一些特异性的指标，对肝癌也有一定的提示意义，如碱性磷酸酶、γ-转肽酶，尤其是异常升高的γ-转肽酶，有的时候在特殊情况下，也提示肝癌的出现。
在一些肿瘤细胞、肝脏的癌细胞中可以合成一些特殊的γ-转肽酶，称之为γ-转肽酶的同工酶。所以如果肝功能里面，γ-转肽酶异常升高，应该警惕，去做相应的一些化验检查、手段，排查肝癌。
如果肝功能中胆红素异常的升高，除了是严重的肝脏功能受损之外，有一些患者，得肝癌以后，肿瘤压迫肝内胆管，也会引起胆红素的升高。所以凡是肝功能异常，都应该去排查是否是肝癌。
