肾脏有小结晶，意味着肾脏内有结晶体的存在，结晶体进一步发展就是结石。晶体是结石的主要组成部分，根据晶体的不同，可以将结石分为含钙结石、感染性结石、胱氨酸结石和尿酸结石。结石可以是单一成分，也可以是复杂成分，结石发生的原因非常复杂，可以将原因归纳为四点，包括外界因素、个体因素、泌尿系统因素以及尿液的成石因素。
在外界因素、个体因素和泌尿系统因素的影响下，会导致尿液中的成石因素增强，抑制成石因素会减弱，尿液中的有形成分被析出，在尿酸增加的检测中，可以看见有不定型的晶体存在。此外，尿液的酸碱度不同，对结晶体的析出也有不同的影响，在碱性尿中容易析出的结晶是磷酸钙结晶、碳酸钙结晶和尿酸钙结晶。在酸性尿中容易析出的结晶是尿酸结晶、草酸钙结晶，胱氨酸结晶、酪氨酸结晶，胆固醇结晶以及磺胺结晶等。这些结晶析出以后，随着成石因素的进一步增强，会导致结石形成
