部分卵巢囊肿可以影响怀孕，要具体情况具体分析。如果卵巢囊肿过大，可以影响卵巢功能，甚至抑制卵巢排卵，导致不能怀孕。还有部分卵巢囊肿引起局部的粘连，或者压迫，导致输卵管通畅度受阻，受精卵不能回到空腔里。部分子宫内膜异位的囊肿，会引起输卵管粘连，影响精子和卵子结合，导致不能怀孕。部分卵巢囊肿，会引起卵巢储备功能差，如子宫内膜异位的囊肿，可以侵蚀正常的卵泡，正常卵泡不断被侵蚀，导致能排出卵子减少，也会影响怀孕。

综上所述，当卵巢囊肿达到一定的严重程度，比如太大，或者发生扭转，局部有压迫症状，或者影响卵巢功能，可能需要进行手术治疗缓解症状。必要时可以剔除囊肿，部分出现粘连的情况，还要做部分分离粘连的整形手术。如果囊肿不大，但是已经侵蚀到正常卵巢组织中的卵泡时，为不影响卵泡的发育，不减少储备的卵泡，也需要进行手术治疗。