手骨关节疼痛的患者，可能是类风湿关节炎、骨关节的退行性病变，以及关节软骨被破坏、消失，造成骨质过度增生，进而出现疼痛。此外，痛风性关节炎、反应性关节炎、银屑病性关节炎，以及强直性脊柱炎，也会表现手关节的疼痛。
如果患者是类风湿关节炎，会造成关节疼痛的原因，主要是滑膜存在炎症，正常的滑膜是3-5层，发生类风湿时，滑膜增生肥厚，通常超过10层。同时滑膜里还会长出新生血管，如血管翳，会侵蚀关节，造成关节腔里软骨破坏，而且往软骨下钻，破坏骨质，造成关节疼痛、变形。
所以手骨关节疼痛的原因，是滑膜的急性炎症转变成慢性炎症，最后造成整个关节的毁损。
