羊水穿刺是使用一根很细的针穿过母亲的腹部，到羊膜腔取少量羊水。羊水穿刺要进行严格的无菌操作，在超声探头引导下，羊水穿刺针沿着超声探头指引的方向进入到羊水暗区，穿刺以后成功抽出羊水。

因为担心母体细胞的污染，最开始的2ml羊水要舍弃，接下来再开始取羊水。羊水取出后要保存在在无菌的试管内，随后送往检验中心进行检测。通常情况下，做羊水穿刺不需要麻醉，因为穿刺针比较细，而且过程比较快，操作也比较简单，因此孕妇及家属不必过于紧张。