胃窦部胃壁增厚的治疗与检查方法及疾病原因有关，若患者进行腹部CT，提示胃窦部胃壁增厚，可能属于正常现象。当患者发生胃萎缩时，在CT上可能会出现上述提示，而进行胃镜检查时却发现胃正常，胃黏膜并未发生明显改变，且胃窦部也无明显异常变化，则无需进行治疗。

若患者进行胃镜检查时，发现胃窦部黏膜充血水肿较严重，甚至出现隆起样病变，可能是由于溃疡引起的周围黏膜肿胀，需给予积极的治疗，较好地控制疾病。但若属于恶性疾病，无论是胃癌，还是胃淋巴瘤导致，预后均较差，可能需要进行手术干预。所以当患者发现胃窦部胃壁增厚时，应明确是否属于正常表现以及出现疾病的原因，如果是由于恶性疾病导致，则治疗效果通常不佳。