核磁共振检查无电离辐射，对人体不会造成辐射损伤，但检查时间相对较长，存在一定噪声，检查过程中射频脉冲会产生热效应，少数患者有可能会出现胸闷、心慌、心悸等不适症状，但比例较少。磁共振检查，例如头颅、颈椎、腰椎等部位，患者处于相对狭小空间，幽闭恐惧症患者可能会出现焦虑、心跳加快等反应。

MR检查前医生会向患者简单介绍检查步骤，告诉患者可能会出现的症状，消除紧张、恐惧心理，使患者精神放松。告知患者扫描时会产生噪声，让患者闭眼，不必理会噪声，必要时会让亲属陪在患者身旁，让亲属握住患者的手增加患者的安全感。告知患者检查大约所需要时间，让患者做好充分的心理准备。

MR检查全过程要求受检部位静止不动，幼儿躁动以及身体不适的老年患者可能无法配合完成检查，会根据患者自身情况选择合适扫描参数，尽量减少扫描时间，必要时会联系临床医生给予镇静药物后再进行检查。